月変は「支給月ベース」で考えるのが基本となります。
4月に支給された3月勤怠の超過残業代については、4月の報酬額算出の際に加算して計算しなければ
なりません。
そのため、4月支給分から固定的賃金が増加している社員については、他の条件もクリアしていると
いう前提となりますが、7月変に該当する可能性があります。

また、3月勤怠分の超過残業代を含めることで、確かに、前月の超過残業代の額によっては7月変で
等級が上がってしまうということがあります。
ですが、今回ご質問いただいた社員の状況の場合、8月変にも該当する可能性もありますため、
8月変についても確認をする必要があります。
※8月変を確認する理由としては、賃金形態の変更により、超過残業代の支払いが5月給与から支給が
　なくなるためです。

今回のように、2か月連続で月変になる可能性が出てくるというのは、貴社のように、
給与が「末締め、当月払い」で起こることですので、今後の昇格等の際は注意してご確認ください。