まず、管理職社員も管理職ではない社員も深夜時間帯に労働をしたことに代わりありませんので、どちらも深夜割増分の賃金（0.25倍）を支払う必要がございます。
加えて、土曜日の労働ということは週40時間の法定労働時間を超過しているため、時間外労働分の割増賃金が発生します。管理職社員は時間外労働の割増賃金の支払対象外ですの関係ありませんが、管理職ではない社員は、深夜割増分（給料の0.25倍）に加えて時間外労働分の割増賃金（給料の0.25倍）を支払う必要がございます。

つまり、管理職ではない社員に対しては、振替休日でまかなわれなかった分の深夜割増分（0.25）と時間外労働分（0.25）を支払う必要があり、管理職の社員に対しては、振替休日でまかなわれなかった分の深夜割増分（0.25）を支払う必要があります。