それぞれ回答いたします。

給与：会社に支払う旨の規定がないのであればノーワークノーペイの原則に則り支払いは不要です。
こちらは念のため、就業規則へも明記しておかれたほうがよいでしょう。

雇用保険：給与の支払いがなければ発生しません。

年金・健康保険：特段保険料免除の事由に該当しませんので、保険料の納付はしなければなりません。
また、保険料は会社と従業員で折半と法律で定められているため、就業規則上に定めたとしても従業員に会社分も支払わせることはできません。

また、前提として、2ヵ月間の休暇を本当に認めるのかという検討が必要かと思います。
今回休暇を認めると、他の従業員の方から申請があった場合も認めざるをえませんし、それが重なってしまえば業務にも支障が出てくることでしょう。
どの程度福利厚生として認めるのか、まずはその線引きとそのルールについての就業規則への明記が必要です。