育児休業の申出をした労働者は、育児休業開始予定日とされた日の前日までは当該育児休業を撤回することができます（育児・介護休業法第8条第1項）。したがって、使用者はすでに派遣契約を延長し、代替要員を確保していることを理由に、復帰を拒否することはできません。

なお、労働者が育児休業の撤回を行った場合、再度の育児休業の申し出は、特別な事情（施行規則第19条参照）があれば、１歳までの育児休業、１歳６ヶ月までの育児休業、２歳までの育児休業のそれぞれにつき可能です。

以上が法律的な解釈ですが、代替要員を確保してしまい人員が余剰となってしまっているというご事情もありますので、復職時は原職復帰が原則ですが上記の経緯を説明し一時的に別業務を実施してもらう等の対策を取られてはいかがでしょうか。