特殊健康診断とは有害物質の取り扱いなど、人体に害のある業務に従事している労働者に対して行われるもので、一般的な健康診断の他に体に影響がある特別な業務をする場合に、受けなくてはならない健康診断です。労働安全衛生法及びじん肺法等で実施が義務づけられているものです。雇い入れの際、当該業務への配置替えの際、及び６箇月以内ごと（四アルキル鉛健康診断は３箇月以内ごと）に１回実施しなければなりません。

特定業務従事者の健康診断とは、深夜業務などの特定業務に従事する労働者に対して当該業務への配置替えの際及び６箇月以内ごとに１回、定期的に定期健康診断と同じ項目で行うものです。（但し、胸部エックス線検査については、１年以内ごとに１回定期的に行えば良い事となっています。）