有給休暇の付与の要件として、全労働日の８割以上出勤していれば、その労働者には年次有給休暇を付与しなければなりません（労働基準法第39条）。
労務不能時は有給休暇を付与しないという法令はありませんので、上記の要件を満たしていれば、労務不能時であっても有給休暇の発生日に付与しなければなりません。

なお、私傷病にて労務不能な状態とのことですので、3日間の待期期間後（待期期間は給与の支払いの有無は問いませんので有給休暇でも成立します）、4日目以降の給与の支払いのなかった日については傷病手当金を受給できますので、有給休暇を消化せず欠勤として、傷病手当金の申請をすることもできますので参考にしていただければと存じます。