お答えいたします。

ご相談の件ですが、30分の欠勤を1時間とすることは、明白に労働者に対して不利益な取扱いとなりますので、行うことはできません。

「5分の遅刻を30分の遅刻として賃金カットをするというような処理は、労働の提供のなかった限度を超えるカット（25分についてのカット）について、賃金の全額払の原則に反し、違法である。
なお、このような取扱いを就業規則に定める減給の制裁として、法第91条の制限内で行う場合には、全額払の原則には反しないものである」（昭63・ 3 ・14基発第150号）